Protein–RNA interactions for Protein: Q78KK3

Slc22a18, Solute carrier family 22 member 18, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a18Q78KK3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc22a18Q78KK3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms