Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smchd1Q6P5D8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smchd1Q6P5D8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms