Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpbp1Q6NXH3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpbp1Q6NXH3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpbp1Q6NXH3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms