Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Wdr44Q6NVE8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms