Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2surpQ6NV83 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2surpQ6NV83 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2surpQ6NV83 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
U2surpQ6NV83 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
U2surpQ6NV83 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
U2surpQ6NV83 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
U2surpQ6NV83 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2surpQ6NV83 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2surpQ6NV83 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2surpQ6NV83 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2surpQ6NV83 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
U2surpQ6NV83 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
U2surpQ6NV83 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
U2surpQ6NV83 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
U2surpQ6NV83 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms