Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fndc3c1Q6DFV6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fndc3c1Q6DFV6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fndc3c1Q6DFV6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fndc3c1Q6DFV6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.1 ms