Protein–RNA interactions for Protein: Q6A026

Pds5a, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5aQ6A026 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pds5aQ6A026 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pds5aQ6A026 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms