Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atg9aQ68FE2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg9aQ68FE2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg9aQ68FE2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms