Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Knl1Q66JQ7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Knl1Q66JQ7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Knl1Q66JQ7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Knl1Q66JQ7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Knl1Q66JQ7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Knl1Q66JQ7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Knl1Q66JQ7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Knl1Q66JQ7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Knl1Q66JQ7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Knl1Q66JQ7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Knl1Q66JQ7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Knl1Q66JQ7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Knl1Q66JQ7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Knl1Q66JQ7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Knl1Q66JQ7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Knl1Q66JQ7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Knl1Q66JQ7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Knl1Q66JQ7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Knl1Q66JQ7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Knl1Q66JQ7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Knl1Q66JQ7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Knl1Q66JQ7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Knl1Q66JQ7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Knl1Q66JQ7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Knl1Q66JQ7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Knl1Q66JQ7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Knl1Q66JQ7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Knl1Q66JQ7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Knl1Q66JQ7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Knl1Q66JQ7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Knl1Q66JQ7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Knl1Q66JQ7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Knl1Q66JQ7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Knl1Q66JQ7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Knl1Q66JQ7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Knl1Q66JQ7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Knl1Q66JQ7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Knl1Q66JQ7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Knl1Q66JQ7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Knl1Q66JQ7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Knl1Q66JQ7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Knl1Q66JQ7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Knl1Q66JQ7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Knl1Q66JQ7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Knl1Q66JQ7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Knl1Q66JQ7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Knl1Q66JQ7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Knl1Q66JQ7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Knl1Q66JQ7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Knl1Q66JQ7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Knl1Q66JQ7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Knl1Q66JQ7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Knl1Q66JQ7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms