Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup62Q63850 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup62Q63850 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms