Protein–RNA interactions for Protein: Q62270

Srms, Tyrosine-protein kinase Srms, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmsQ62270 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrmsQ62270 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrmsQ62270 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrmsQ62270 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms