Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3a2Q62203 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3a2Q62203 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms