Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcd2Q61285 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd2Q61285 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms