Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Traf3Q60803 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Traf3Q60803 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf3Q60803 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.6 ms