Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb6Q60692 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb6Q60692 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 254.4 ms