Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sin3aQ60520 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sin3aQ60520 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sin3aQ60520 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 281.6 ms