Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms