Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SynrgQ5SV85 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SynrgQ5SV85 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SynrgQ5SV85 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SynrgQ5SV85 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SynrgQ5SV85 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SynrgQ5SV85 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SynrgQ5SV85 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SynrgQ5SV85 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SynrgQ5SV85 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SynrgQ5SV85 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SynrgQ5SV85 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SynrgQ5SV85 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SynrgQ5SV85 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SynrgQ5SV85 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SynrgQ5SV85 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SynrgQ5SV85 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SynrgQ5SV85 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SynrgQ5SV85 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms