Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Psme4Q5SSW2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psme4Q5SSW2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms