Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Mdc1Q5PSV9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mdc1Q5PSV9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms