Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU5

Fbxo39, F-box only protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo39Q5NBU5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo39Q5NBU5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms