Protein–RNA interactions for Protein: Q5F289

Spem1, Spermatid maturation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spem1Q5F289 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spem1Q5F289 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spem1Q5F289 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms