Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spire1Q52KF3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spire1Q52KF3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spire1Q52KF3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms