Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.27■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Afg1lQ3V384 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Afg1lQ3V384 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Afg1lQ3V384 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Afg1lQ3V384 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Afg1lQ3V384 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Afg1lQ3V384 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Afg1lQ3V384 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Afg1lQ3V384 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Afg1lQ3V384 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Afg1lQ3V384 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg1lQ3V384 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg1lQ3V384 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg1lQ3V384 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg1lQ3V384 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg1lQ3V384 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg1lQ3V384 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg1lQ3V384 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg1lQ3V384 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg1lQ3V384 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg1lQ3V384 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg1lQ3V384 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg1lQ3V384 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg1lQ3V384 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg1lQ3V384 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg1lQ3V384 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms