Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Skap1Q3UUV5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.4 ms