Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Prdm10Q3UTQ7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Prdm10Q3UTQ7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prdm10Q3UTQ7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms