Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkain3Q3URJ8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkain3Q3URJ8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms