Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Parp3Q3ULW8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Parp3Q3ULW8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Parp3Q3ULW8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Parp3Q3ULW8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Parp3Q3ULW8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Parp3Q3ULW8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Parp3Q3ULW8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Parp3Q3ULW8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Parp3Q3ULW8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Parp3Q3ULW8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Parp3Q3ULW8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Parp3Q3ULW8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Parp3Q3ULW8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Parp3Q3ULW8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Parp3Q3ULW8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Parp3Q3ULW8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Parp3Q3ULW8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Parp3Q3ULW8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Parp3Q3ULW8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Parp3Q3ULW8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Parp3Q3ULW8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms