Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI43

Babam1, BRISC and BRCA1-A complex member 1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Babam1Q3UI43 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Babam1Q3UI43 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Babam1Q3UI43 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Babam1Q3UI43 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms