Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctu2Q3U308 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms