Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy4Q3TYX8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rufy4Q3TYX8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy4Q3TYX8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms