Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
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Lrrn4clQ3TYX2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn4clQ3TYX2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn4clQ3TYX2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn4clQ3TYX2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn4clQ3TYX2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn4clQ3TYX2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn4clQ3TYX2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn4clQ3TYX2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn4clQ3TYX2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn4clQ3TYX2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn4clQ3TYX2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Lrrn4clQ3TYX2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn4clQ3TYX2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn4clQ3TYX2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Lrrn4clQ3TYX2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrn4clQ3TYX2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Lrrn4clQ3TYX2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrn4clQ3TYX2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Lrrn4clQ3TYX2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrn4clQ3TYX2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Lrrn4clQ3TYX2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Lrrn4clQ3TYX2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Lrrn4clQ3TYX2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lrrn4clQ3TYX2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrn4clQ3TYX2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrn4clQ3TYX2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrn4clQ3TYX2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrn4clQ3TYX2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Lrrn4clQ3TYX2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrn4clQ3TYX2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrn4clQ3TYX2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrn4clQ3TYX2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrn4clQ3TYX2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Lrrn4clQ3TYX2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrn4clQ3TYX2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrn4clQ3TYX2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrn4clQ3TYX2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrn4clQ3TYX2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrn4clQ3TYX2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrn4clQ3TYX2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrn4clQ3TYX2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrn4clQ3TYX2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrn4clQ3TYX2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrn4clQ3TYX2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrn4clQ3TYX2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrn4clQ3TYX2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrn4clQ3TYX2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrn4clQ3TYX2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrn4clQ3TYX2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrn4clQ3TYX2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrn4clQ3TYX2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrn4clQ3TYX2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrn4clQ3TYX2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrn4clQ3TYX2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms