Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdlim7Q3TJD7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdlim7Q3TJD7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms