Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppp4r2Q0VGB7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppp4r2Q0VGB7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppp4r2Q0VGB7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms