Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pate4Q09098 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pate4Q09098 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pate4Q09098 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms