Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MitfQ08874 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MitfQ08874 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MitfQ08874 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MitfQ08874 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MitfQ08874 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MitfQ08874 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MitfQ08874 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MitfQ08874 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MitfQ08874 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms