Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MestQ07646 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MestQ07646 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MestQ07646 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MestQ07646 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MestQ07646 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MestQ07646 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MestQ07646 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MestQ07646 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MestQ07646 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MestQ07646 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MestQ07646 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MestQ07646 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MestQ07646 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MestQ07646 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MestQ07646 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MestQ07646 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MestQ07646 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MestQ07646 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MestQ07646 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MestQ07646 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MestQ07646 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MestQ07646 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MestQ07646 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MestQ07646 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MestQ07646 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MestQ07646 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MestQ07646 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MestQ07646 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MestQ07646 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MestQ07646 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MestQ07646 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MestQ07646 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MestQ07646 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MestQ07646 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MestQ07646 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MestQ07646 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MestQ07646 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MestQ07646 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MestQ07646 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MestQ07646 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MestQ07646 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MestQ07646 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MestQ07646 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MestQ07646 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MestQ07646 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MestQ07646 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MestQ07646 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MestQ07646 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MestQ07646 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MestQ07646 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MestQ07646 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MestQ07646 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MestQ07646 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MestQ07646 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MestQ07646 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MestQ07646 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MestQ07646 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MestQ07646 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MestQ07646 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MestQ07646 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MestQ07646 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MestQ07646 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MestQ07646 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MestQ07646 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MestQ07646 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MestQ07646 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MestQ07646 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MestQ07646 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MestQ07646 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MestQ07646 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MestQ07646 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MestQ07646 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MestQ07646 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MestQ07646 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MestQ07646 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MestQ07646 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MestQ07646 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MestQ07646 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MestQ07646 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MestQ07646 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MestQ07646 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MestQ07646 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MestQ07646 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MestQ07646 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MestQ07646 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MestQ07646 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MestQ07646 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MestQ07646 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MestQ07646 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MestQ07646 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MestQ07646 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MestQ07646 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MestQ07646 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MestQ07646 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MestQ07646 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MestQ07646 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MestQ07646 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MestQ07646 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MestQ07646 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms