Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Caprin2Q05A80 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms