Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mex3cQ05A36 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mex3cQ05A36 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mex3cQ05A36 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161 ms