Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Epha4Q03137 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Epha4Q03137 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms