Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ascl1Q02067 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms