Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf1bP97358 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Taf1bP97358 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf1bP97358 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf1bP97358 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms