Protein–RNA interactions for Protein: P70407

Cdh9, Cadherin-9, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh9P70407 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh9P70407 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh9P70407 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh9P70407 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh9P70407 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh9P70407 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh9P70407 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh9P70407 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh9P70407 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh9P70407 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh9P70407 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh9P70407 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh9P70407 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh9P70407 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh9P70407 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh9P70407 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh9P70407 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh9P70407 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh9P70407 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh9P70407 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh9P70407 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cdh9P70407 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh9P70407 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh9P70407 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh9P70407 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh9P70407 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh9P70407 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh9P70407 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh9P70407 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh9P70407 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh9P70407 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh9P70407 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh9P70407 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh9P70407 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh9P70407 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh9P70407 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh9P70407 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh9P70407 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh9P70407 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh9P70407 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cdh9P70407 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdh9P70407 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdh9P70407 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdh9P70407 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdh9P70407 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh9P70407 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh9P70407 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh9P70407 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh9P70407 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh9P70407 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh9P70407 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh9P70407 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh9P70407 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh9P70407 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh9P70407 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh9P70407 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh9P70407 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh9P70407 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh9P70407 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms