Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frat1P70339 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frat1P70339 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frat1P70339 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frat1P70339 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frat1P70339 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frat1P70339 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frat1P70339 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frat1P70339 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frat1P70339 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frat1P70339 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frat1P70339 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms