Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd13P70217 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd13P70217 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd13P70217 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd13P70217 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd13P70217 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms