Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Acta1P68134 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Acta1P68134 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Acta1P68134 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acta1P68134 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acta1P68134 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acta1P68134 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acta1P68134 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acta1P68134 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Acta1P68134 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Acta1P68134 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Acta1P68134 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Acta1P68134 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms