Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sumo1P63166 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sumo1P63166 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sumo1P63166 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sumo1P63166 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sumo1P63166 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sumo1P63166 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sumo1P63166 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sumo1P63166 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sumo1P63166 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sumo1P63166 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sumo1P63166 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sumo1P63166 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sumo1P63166 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sumo1P63166 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sumo1P63166 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sumo1P63166 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sumo1P63166 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sumo1P63166 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sumo1P63166 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sumo1P63166 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms