Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab1AP62821 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab1AP62821 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab1AP62821 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab1AP62821 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms