Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smg6P61406 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smg6P61406 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smg6P61406 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smg6P61406 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smg6P61406 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smg6P61406 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smg6P61406 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Smg6P61406 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Smg6P61406 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Smg6P61406 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smg6P61406 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Smg6P61406 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Smg6P61406 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms