Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Fgd1P52734 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fgd1P52734 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fgd1P52734 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms